专场1：生物产业中强大的硬件和软件
时间：2010年6月24日，星期四，08:30-12:10
地点：No. 5 会议室，2楼 |
主席 |
Susanna-Assunta Sansone博士，英国欧洲生物信息研究所团队协调人 |
副主席 |
高义勤博士，美国加州理工学院助理教授 |
08:30-08:55 |
题目：Standards and Ontologies for Multi-omics Studies: Focus on Synergistic Efforts
Susanna-Assunta Sansone博士，英国欧洲生物信息研究所团队协调人 |
08:55-09:20 |
题目：ISA Infrastructure: Supporting Standards-compliant Experimental Reporting and Enabling Curation at Community Level
Philippe Rocca-Serra博士，英国欧洲生物信息研究所技术协调人
共同演讲人：Eamonn Maguire博士，英国欧洲生物信息研究所团队协调人 |
09:20-09:45 |
题目：Comprehensive Library for Modern Biotechnology (CLiMB): Sequence Analysis Section
梁绍光博士，中国华大基因生物信息云计算应用开发主管 |
09:45-10:10 |
题目：Toward High Efficiency Computing for Genomics: Merge the Gap between Silicon and Applications Performance
王丙强博士，中国深圳华大基因研究院计算平台软件优化主管 |
10:10-10:30 |
茶歇 |
10:30-10:55 |
题目：Sequence, Temperature, and Cosolvent Dependence of Simple Protein Structures
高义勤博士，美国加州理工学院助理教授 |
10:55-11:20 |
题目：Comprehensive Library for Modern Biotechnology (CLiMB): Database Section
田晶博士，华大基因数据库运营主管 |
11:20-11:45 |
题目：Periodic Analysis on the Psychotic Episode of Individual Schizophrenics by Data Construction Method
王小璠博士，台湾国立清华大学教授 |
11:45-12:10 |
题目：Parallel Optimization of MrBayes Using Graphic Processing Unit
王刚博士，中国南开大学教授 |
专题2-1：信息技术在系统生物学和计算生物学中的应用
时间：2010年6月24日，星期四，13:30-15:30
地点：No. 5 会议室，2楼 |
主席 |
Pietro Cortona博士，法国巴黎中央理工学院教授 |
13:30-13:55 |
题目：Density-functional Theory: a Tool in Drug Discovery, a Bridge between Quantum Chemistry and Biology
Pietro Cortona博士，法国巴黎中央理工学院教授 |
13:55-14:20 |
题目：One-dimensional Modeling of Blood Circulation in the Human Upper Limb and Its Application in the Analysis of Heat Transfer in the Image-based Hand Model
贺缨博士，中国科学技术大学教授 |
14:20-14:45 |
题目：Accurate Charges for Docking of Metalloproteins
Art E. Cho博士，韩国高丽大学教授 |
14:45-15:10 |
题目：AFMPB: An Adaptive Fast Multipole Poisson–Boltzmann Solver for Calculating Electrostatics in Biomolecular Systems
卢本卓博士，中科院数学与系统科学研究院，计算数学所副教授 |
15:10-15:30 |
茶歇 |
专题2-2：利用计算机模拟基因调节、表达、路径和网络
时间：2010年6月24日，星期四，15:30-17:35
地点：No. 5 会议室，2楼 |
主席 |
胡建民博士，美国宾夕法尼亚州立大学医学院教授 |
副主席 |
Ken Takahashi博士，日本名古屋大学医学院助理教授 |
15:30-15:55 |
题目：Novel Strategies to Inhibit Hepatitis B Virus Reverse Transcriptase
胡建民博士，美国宾夕法尼亚州立大学医学院教授 |
15:55-16:20 |
题目：Developing Accurate Quantum-based Polarized Force Field for Proteins
张增辉博士， 中国华东师范大学化学系教授 |
16:20-16:45 |
题目：How Do We Know Force Inside the Body? – Finite Element Stress Analysis
Ken Takahashi博士，日本名古屋大学医学院助理教授 |
16:45-17:10 |
题目：Modelling Immune Response and Memory by Concepts of Network Theory
Chung-Ming Ou博士，台湾开南大学 |
17:10-17:35 |
题目：Electrophysiological Simulation of Developmental Changes in Cardiomyocyte
Hitomi I. Sano博士，日本庆应义塾大学研究员 |
专题2-3：生物信息学中的基因组学、蛋白质组学、转录组学和代谢物组学
时间：2010年6月24日，星期四，13:30-17:10
地点：No. 6 会议室，2楼 |
主席 |
朱军博士，中国浙江大学生物信息学研究所所长 |
副主席 |
Mitsutoshi Setou博士，日本滨松医科大学教授 |
13:30-13:55 |
Keynote Speech:
题目：Information Systems to Define and Track Biomarkers for Personalized Genomics
Xitong Li博士，美国Genomic Health 公司高级经理，生物信息主管 |
13:55-14:20 |
题目：Identification of Comparative Molecular Interactions by Computationally Intensive Modeling Methods
宋明舟博士，美国新墨西哥州立大学副教授 |
14:20-14:45 |
题目：SOAPas: Ab initio Detection of Alternative Splicing Events with RNA-Seq
彭智宇博士，中国深圳华大基因研究院生物信息室RNA 数据分析 |
14:45-15:10 |
题目：Computation and Presentation of Genetic Analysis for Complex Traits
朱军博士，中国浙江大学生物信息学研究所所长 |
15:10-15:30 |
茶歇 |
15:30-15:55 |
题目：Gene-set Cohesion Analysis Tool (GCAT): A Literature Based Web Tool for Calculating Functional Cohesiveness of Gene Groups
Lijing Xu博士，美国孟菲斯大学研究员 |
15:55-16:20 |
题目：GenomeMap – An Open Framework for Genome Annotation Visualization, Retrieve and Analysis
孔雷博士，中国北京大学生物信息中心 |
16:20-16:45 |
题目：Development of Imaging Mass Spectrometry Instrument “Mass Microscope”
Mitsutoshi Setou博士，日本滨松医科大学教授 |
16:45-17:10 |
题目：Intramolecular Energy Transfer Ways in Proteins, A Computational Approach
Janneth González Santos博士，哥伦比亚贾弗里阿纳大学教授 |
专题3-1：计算化学、分子动力学和生物信息学
时间：2010年6月24日，星期四，08:30-12:10
地点：No. 6 会议室，2楼 |
主席 |
金钟博士，中国科学院超级计算中心多学科/重点科学大规模计算软件与实现主管、计算化学虚拟实验室执行负责人兼技术主管和中美联合科学计算中心执行负责人 |
副主席 |
于建国博士，中国北京师范大学教授 |
08:30-08:55 |
主题演讲:
题目：Computational Polypharmacology Studies for Traditional Chinese Medicine
徐筱杰博士，中国北京大学教授、主任 |
08:55-09:20 |
题目：GridMol: A 3D Molecular Modeler and Visualizer on Grid
金钟博士，中国科学院超级计算中心多学科/重点科学大规模计算软件与实现主管、计算化学虚拟实验室执行负责人兼技术主管和中美联合科学计算中心执行负责人 |
09:20-09:45 |
题目：Theoretical Investigations on the Electron Transfer in Photosynthesis of Purple Bacteria
Takao Tsuneda博士，日本先端科学机构领导 |
09:45-10:10 |
题目： SimuPac – A Bio and Chem Simulation Software. Our Architecture and Implement
余建国博士，中国北京师范大学教授 |
10:10-10:30 |
茶歇 |
10:30-10:55 |
题目： From the Viral Tool Box: Assembling within the Lipid Membrane
Wolfgang B. Fischer博士，台湾國立陽明大學副教授 |
10:55-11:20 |
题目：Molecular Dynamics Study of Liposomes: A Coarse-Grained Molecular Modeling Approach
Wataru Shinoda博士，日本产业技术总合研究所领导 |
11:20-11:45 |
题目：Spectral Tuning Mechanism in Photofunctional Proteins: A SAC-CI Theoretical Study
Jun-ya Hasegawa博士，日本京都大学 |
11:45-12:10 |
讨论 |
专题3-2：计算机辅助药物设计
时间：2010年6月24日，星期四，08:30-09:45
地点：No. 8 会议室，2楼 |
主席 |
Jun Zeng博士，澳大利亚Qubist分子设计公司共同创始人及首席科学官 |
08:30-08:55 |
题目：Advanced Methods in Fragment-Based Drug Design and Virtual Screening Applications
Jun Zeng博士，澳大利亚Qubist分子设计公司共同创始人及首席科学官 |
08:55-09:20 |
题目：Advances and Challenges for Computational Drug Design
Jung-Hsin Lin博士，台湾中央研究院助理研究员 |
09:20-09:45 |
题目：Development of Element Modules for Virtual Liver and It's Application
Kyoung Tai No博士，韩国延世大学教授
共同演讲人：Won Seok Oh博士，韩国生物科学与生物技术协会 |
